低温喷雾干燥机在进行操作的过程中为了能够有效的保证其管道和所有的成品接触的部件的清洗，在进行使用时可以得到一流的产品，有规则的清洗设备是十分必要的。当产品品种更换时，或是喷雾干燥机设备已经停产24h以上而未清洗的，应作一次全面彻底的清洗。
低温喷雾干燥机在使用时清洗方法在一定程度上是可以根据实际选择干洗、湿洗或化学洗，在进行干洗的过程中，可以有效的用刷子、吸尘器进行清扫，湿洗：用60~80℃的热水进行清洗。
低温喷雾干燥机在采用化学清洗的过程中，在进行操作的过程中可以采用酸液、碱液以及各种洗涤剂清洗，在进行使用时其中酸洗，会有效的将其HNO3配成1~2%浓度的溶液，加热温度不超过65℃进行洗涤，然后用水清洗；碱洗：将NaOH配成0.5~1%浓度的溶液，加热温度不超过65℃进行洗涤，然后用清水清洗。
低温喷雾干燥机在一定程度上应该有效的按照其周围的环境条件，其空气的含尘量的高低而定，一般含量高的3~6星期清洗一次，含尘量低的6~8星期清洗一次。其中的不锈钢细丝，用碱洗法洗涤后，仍应均匀地敷设到空气过滤器的框架内，并喷以轻质锭子油或真空泵。
低温喷雾干燥机的使用特点
1.低温喷雾干燥机的干燥速度快且料液在一定程度上有效的经过其雾化后其表面打增加，在热风气流中，瞬间就可蒸发95%—98%的水份。完成干燥时间只需5-15秒，具有瞬时干燥特点.
2.特殊的分风装置,降低了设备阻力,并有效提供了干燥器的处理风置.
3.生产过程简化，适宜连续控制生产，含湿量40-90%的液体，一次干燥成粉，减少粉碎，筛选等工序提高产品纯度.
4.低温喷雾干燥机在运行时，其物料在短时间内完成干燥过程，在一定程度上能够适应于热敏性物料的干燥，能保持物料色、香、味.产品分散性、流动性、溶解性良好，产品粒径、松散度，水份在一定范围内可调。
